어진좌는 경행천황 43년(기원 113년)으로 거슬러 올라간다. 연장 5년(기원 927년)에 완성된 연희식 신명장에 기재된, 영험 특히 현저하다고 하는 메이진타이샤.
약 1900년 전 일본 무존의 성령이 야히로의 백조가 되어 날아갔다. 백조는 야마토의 고토인하라, 가와치의 고시에 춤추고, 마지막으로 내려선 땅에 일본 무존을 모시는 것이 당사의 기원.
백조가 튕겨 내렸을 때 하룻밤으로 하여 수목이 자라며 시라토리가 다시 날아갈 수 없게 되었다는 전설이 남아 신역을 '천종의 삼림'이라고 한다.